1 安装驱动程序，SQL Server2000将三个.jar加到环境变量。
2 修改 weka\experiment下的DatabaseUtils.props文件。
我们可以看到有DatabaseUtils.props.odbc DatabaseUtils.props.oracle等
我们先将DatabaseUtils.props随便改成一个其他的名字，然后将DatabaseUtils.props.mssqlserver改成DatabaseUtils.props，
打开现在的DatabaseUtils.props可以看到以下部分：（#表示注释）

2.1驱动加载
# JDBC driver (comma-separated list)
jdbcDriver=com.microsoft.jdbc.sqlserver.SQLServerDriver
2.2数据库连接，如果在本机上可以将server_name改为127.0.0.1或者localhost
# database URL
jdbcURL=jdbc:sqlserver://127.0.0.1:1433
2.3数据类型的转换。由于weka仅支持名词型（nominal）、数值型（numeric）、字符串、日期（date）。所以我们要将现在数据库中的数据类型对应到这四种类型上来。

将以下数据类型对应的句子前面的注释符合去掉。由于SQL Server2000有其他的数据类型Weka尚不能识别，所以我们在下面再添加上
smallint=3
datetime=8等等

string,getString()= 0;         -->nominal
boolean,getBoolean() = 1;  -->nominal
double,getDouble() = 2;    -->numeric
byte,getByte() = 3;        -->numeric
short,getByte()= 4;        -->numeric
int,getInteger() = 5;            -->numeric
long,getLong() = 6;                -->numeric
gloat,getFloat() = 7;            -->numeric
date,getDate() = 8;                -->date
varchar=0
float=2
tinyint=3
int=5
3其他说明，我们暂时用不到，不用去管了
# other options
CREATE_DOUBLE=DOUBLE PRECISION
CREATE_STRING=VARCHAR(8000)
CREATE_INT=INT
checkUpperCaseNames=false
checkLowerCaseNames=false
checkForTable=true

4 OK，下面可以操作了！运行weka的Explore界面后，通过Open DB..打开SQL Viewer工作界面（3.5.5版本比3.4.10在这里精细了许多）。
通过user我们设置好用户名和密码后即可connect；连接成功后，可以通过书写sql语句查询出想要的结果后，OK即可在Explore界面的
preprocoss面板中看到了输入的数据。
在连接读取数据库的数据时，SQL Viewer面板也提供了Info，相当与我们单纯用jdbc连接数据库时的调试信息。

下面是我在网上下的一个工具（java源码，下载于souceforge网站），可以把数据库中的数据转换为Weka使用的.arff文件。当然，前提是安装了该数据库的驱程。有兴趣者可以一看。